In einer kürzlich von den Forschern des schwedischen Karolinska-Instituts durchgeführten Studie wurde eine neue kostengünstige Methode entwickelt, mit der sehr heterogene Tumoren identifiziert werden können, die in Zukunft sehr aggressiv werden können und daher aggressiver behandelt werden müssen. Lesen Sie auch – Schmerzlose Methode zur Bewertung der Tumorprogression entwickelt: Studie
Die Studie wurde in der Zeitschrift “Nature Communications” veröffentlicht. Ein gemeinsames Merkmal von Krebszellen sind Veränderungen in der Anzahl der Kopien, in denen jedes Chromosom oder Gen im Genom vorhanden ist – ein Phänomen, das als Kopienzahländerungen oder CNAs bekannt ist. Innerhalb desselben Tumors können Zellen, die zu verschiedenen anatomischen Teilen des Tumors gehören, unterschiedliche CNAs tragen. Tumoren mit vielen CNAs sind in der Regel sehr aggressiv und neigen dazu, sich auch nach harten Behandlungen häufiger zu bessern. Lesen Sie auch – Vorgeschlagene Krebsbehandlung kann die Krankheit verstärken: Studie
Das Bienko-Crosetto-Labor am Karolinska-Institut und das Science for Life-Labor in Schweden haben eine neue genomische Methode namens CUTseq entwickelt, mit der Menge und Art der CNAs in vielen verschiedenen Teilen desselben Tumors zu wesentlich geringeren Kosten als bisher bewertet werden können Technologien. Lesen Sie auch – Eine proteinarme Diät kann Ihnen helfen, Krebs zu heilen
Nicola Crosetto, ein leitender Forscher am Institut für Medizinische Biochemie und Biophysik, sagte: „Ich gehe davon aus, dass CUTseq viele nützliche Anwendungen in der Krebsdiagnostik finden wird. Die Multiregion-Tumorsequenzierung wird zunehmend im diagnostischen Umfeld eingesetzt, um Patienten mit sehr heterogenen Tumoren zu identifizieren, die aggressiver behandelt werden müssen. Ich glaube, dass unsere Methode hier eine führende Rolle spielen kann. “
Die Methode arbeitet mit DNA, die aus mehreren Biopsien und sogar aus sehr kleinen Teilen dünner Gewebeschnitte extrahiert wurde – die Art von Probe, auf die sich Pathologen üblicherweise verlassen, um eine Krebsdiagnose unter dem Mikroskop zu stellen.
Durch Markieren der aus mehreren Regionen derselben Tumorprobe extrahierten DNA mit einzigartigen molekularen Barcodes kann mit einem einzigen Sequenzierungsexperiment ein umfassendes Bild der Heterogenität von CNAs in einem Tumor erhalten werden.
Die Anwendungen von CUTseq beschränken sich laut den Forschern hinter der neuen Methode nicht nur auf die Krebsdiagnostik.
“Zum Beispiel könnte CUTseq als Plattform für die Authentifizierung von Zelllinien und zur Überwachung der Genomstabilität in großen Zelllinien-Repositories und Biobanken verwendet werden”, sagte Magda Bienko, eine leitende Forscherin derselben Abteilung. “Es könnte auch in der Ökologie als Alternative zu anderen Genomsequenzierungsmethoden mit reduzierter Repräsentation wie RAD-seq angewendet werden, um die Biodiversität auf kostengünstige Weise zu bewerten”, fügte Bienko hinzu.
Veröffentlicht: 19. Oktober 2019, 9:49 Uhr
